Jest procesem niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania basenu. Do wody dostają się różnego typu zanieszczyszczenia, aby je wyeleminować montujemy filtry piaskowe wypełnione złożem kwarcowym. Zaleca się aby woda w basenie była przefiltrowana ok.3 razy w ciągu doby (przeważnie jest to czas ok. 7 godzin).
Podczas filtracji woda przepływająca przez złoże w zbiorniku filtra formuje kanaliki, przez które przepływa. Z czasem kanaliki te zapychają się i konieczne jest płukanie filtra. Niedopuszczalne jest doprowadzenie do sytuacji kiedy ciśnienie w filtrach przekracza wartość 1,5 bar.

